Основным элементом БЭМ является квадрупольная ловушка Пауля, которая позволяет удерживать одиночные частицы размером
от ~100нм до ~100мкм. Заряженные частицы удерживаются в пространстве за счёт взаимодействия с электрическим полем ловушки. Так локализованные частицы и не испытывают прямого контакта с подложкой или иной системой механических держателей и буквально левитируют в пространстве.
Дизайн корпуса БЭМ обеспечивает его совместимость с любым коммерчески доступным люминесцентным микроскопом, и поддерживает работу со стандартными микроскопическими длиннофокусными объективами